Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 BNIP3P11-201ENST00000603878 563 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 TAF8-207ENST00000482432 556 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AC008751.2-201ENST00000597885 980 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AC004987.4-201ENST00000603383 338 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
KNOP1Q1ED39 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 204.3 ms