Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 AF127577.1-201ENST00000446301 562 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 GTF2IP9-201ENST00000502460 301 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 AC119751.5-201ENST00000514077 770 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 AL132857.1-201ENST00000555180 708 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 MTCO2P2-201ENST00000591258 225 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 DUXAP10-204ENST00000612052 616 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 AC022960.3-201ENST00000619794 441 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 AL390783.1-203ENST00000457058 248 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 TPT1P8-201ENST00000510120 555 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 AC018371.1-201ENST00000584560 640 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 AC009974.1-201ENST00000608881 455 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 AC092155.2-201ENST00000454675 477 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NRF1Q16656 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.9 ms