Protein–RNA interactions for Protein: Q15465

SHH, Sonic hedgehog protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHHQ15465 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AC104229.1-201ENST00000561364 255 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AC008507.2-201ENST00000588402 1176 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AL606834.3-201ENST00000602615 496 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AL445435.1-201ENST00000604232 665 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SHHQ15465 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SHHQ15465 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SHHQ15465 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SHHQ15465 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SHHQ15465 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SHHQ15465 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SHHQ15465 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AC008432.1-201ENST00000615912 1320 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SHHQ15465 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SHHQ15465 RNU6-298P-201ENST00000390888 96 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SHHQ15465 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SHHQ15465 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AL606495.1-201ENST00000422100 813 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SHHQ15465 NANOGP5-201ENST00000424456 877 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SHHQ15465 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SHHQ15465 ZNF736P7Y-201ENST00000425158 820 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SHHQ15465 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SHHQ15465 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SHHQ15465 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SHHQ15465 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SHHQ15465 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SHHQ15465 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SHHQ15465 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SHHQ15465 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SHHQ15465 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
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SHHQ15465 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
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SHHQ15465 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SHHQ15465 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AC078880.5-201ENST00000617845 421 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SHHQ15465 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SHHQ15465 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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SHHQ15465 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SHHQ15465 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SHHQ15465 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SHHQ15465 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SHHQ15465 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SHHQ15465 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SHHQ15465 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SHHQ15465 AGBL4-IT1-201ENST00000457061 514 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SHHQ15465 AC112695.1-201ENST00000504213 592 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SHHQ15465 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SHHQ15465 AC113420.1-201ENST00000507903 571 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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SHHQ15465 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SHHQ15465 AC104827.1-202ENST00000511917 1049 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SHHQ15465 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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SHHQ15465 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SHHQ15465 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SHHQ15465 AL022067.1-201ENST00000602426 454 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SHHQ15465 AC113368.1-201ENST00000603736 382 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SHHQ15465 AC099785.1-201ENST00000605697 437 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SHHQ15465 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SHHQ15465 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SHHQ15465 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SHHQ15465 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SHHQ15465 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SHHQ15465 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SHHQ15465 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SHHQ15465 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SHHQ15465 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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