Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRKQ15262 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRKQ15262 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRKQ15262 GTF2IP9-201ENST00000502460 301 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRKQ15262 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRKQ15262 AC091814.1-201ENST00000545258 719 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRKQ15262 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRKQ15262 SUMO2P14-201ENST00000604488 293 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
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PTPRKQ15262 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
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PTPRKQ15262 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRKQ15262 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRKQ15262 AC005772.1-201ENST00000446671 976 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
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PTPRKQ15262 ADAM3B-201ENST00000569937 840 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
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PTPRKQ15262 AC073111.2-201ENST00000605657 1075 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
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PTPRKQ15262 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRKQ15262 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRKQ15262 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRKQ15262 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRKQ15262 SERPINI2-206ENST00000471111 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
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PTPRKQ15262 C1orf185-204ENST00000612209 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
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PTPRKQ15262 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRKQ15262 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
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PTPRKQ15262 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
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PTPRKQ15262 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRKQ15262 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
PTPRKQ15262 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
PTPRKQ15262 HMGB1P13-201ENST00000406019 642 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRKQ15262 RNU4-74P-201ENST00000411280 161 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRKQ15262 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRKQ15262 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
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