Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 CDC14A-206ENST00000635056 2056 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 COX6CP15-201ENST00000426313 211 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 AL360081.1-201ENST00000428299 555 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 AC008745.1-201ENST00000604064 271 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 AL031656.1-202ENST00000457704 1995 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 GABRG2-228ENST00000640985 3086 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 AC005261.2-201ENST00000593427 4258 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 AL121974.1-201ENST00000437859 377 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 RBMY2TP-201ENST00000451162 947 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 AC097103.1-201ENST00000512398 273 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 DTNA-227ENST00000597599 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 AL132765.1-201ENST00000434165 553 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 AL031584.1-201ENST00000447169 754 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
COL9A3Q14050 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.9 ms