Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 AP001992.1-204ENST00000525104 687 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 AC099654.11-201ENST00000638857 294 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 GTF2IP9-201ENST00000502460 301 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 LINC01614-201ENST00000415479 648 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 RAB3GAP1-202ENST00000425393 1139 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 XKRY2-201ENST00000442362 1093 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 AC091544.1-201ENST00000484702 348 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC1.47□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 ABI1P1-201ENST00000603375 1120 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 AC025016.1-201ENST00000616746 682 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 ARL5AP3-201ENST00000439327 386 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 AL023584.2-201ENST00000454411 444 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 AC109349.1-201ENST00000503299 758 ntTSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC1.45□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 AC017078.1-201ENST00000416146 368 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 AC124069.1-201ENST00000517454 735 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 AC008126.1-201ENST00000549019 480 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
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