Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 AL355480.1-201ENST00000629041 99 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 MIR1286-201ENST00000408112 78 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 RPS26P39-201ENST00000469206 341 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 SLC14A2-AS1-201ENST00000585759 494 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 AL512329.2-201ENST00000607350 548 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 AC012400.1-201ENST00000518452 381 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 AC125603.1-201ENST00000552718 366 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 AC068397.1-201ENST00000560337 531 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 DSCR9-205ENST00000585273 751 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NCOA4Q13772 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.2 ms