Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 AC010105.1-201ENST00000437290 385 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HTR4Q13639 C1orf143-201ENST00000443836 762 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HTR4Q13639 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HTR4Q13639 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HTR4Q13639 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HTR4Q13639 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HTR4Q13639 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HTR4Q13639 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HTR4Q13639 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HTR4Q13639 AC025300.1-201ENST00000526616 384 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HTR4Q13639 OSBPL9P3-201ENST00000534523 595 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HTR4Q13639 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HTR4Q13639 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HTR4Q13639 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HTR4Q13639 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HTR4Q13639 AL034549.1-201ENST00000615120 578 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HTR4Q13639 MIR1264-201ENST00000616374 69 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HTR4Q13639 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HTR4Q13639 AL121594.5-201ENST00000631724 573 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HTR4Q13639 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HTR4Q13639 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HTR4Q13639 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
HTR4Q13639 MTND5P11-201ENST00000511037 1812 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HTR4Q13639 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HTR4Q13639 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
HTR4Q13639 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
HTR4Q13639 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
HTR4Q13639 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
HTR4Q13639 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
HTR4Q13639 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HTR4Q13639 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HTR4Q13639 RNU6-883P-201ENST00000384597 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HTR4Q13639 TATDN1P1-201ENST00000414123 891 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HTR4Q13639 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
HTR4Q13639 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
HTR4Q13639 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HTR4Q13639 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HTR4Q13639 MTND1P33-201ENST00000446251 917 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HTR4Q13639 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HTR4Q13639 AL450344.2-201ENST00000455229 614 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
HTR4Q13639 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HTR4Q13639 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HTR4Q13639 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
HTR4Q13639 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HTR4Q13639 AC138956.1-201ENST00000508187 504 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
HTR4Q13639 AC104827.1-202ENST00000511917 1049 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
HTR4Q13639 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
HTR4Q13639 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
HTR4Q13639 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HTR4Q13639 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HTR4Q13639 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
HTR4Q13639 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
HTR4Q13639 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HTR4Q13639 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HTR4Q13639 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
HTR4Q13639 AL109659.3-201ENST00000624985 950 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HTR4Q13639 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
HTR4Q13639 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
HTR4Q13639 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
HTR4Q13639 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
HTR4Q13639 OR5T3-201ENST00000303059 1023 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HTR4Q13639 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HTR4Q13639 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HTR4Q13639 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HTR4Q13639 NRG4-201ENST00000394907 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
HTR4Q13639 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
HTR4Q13639 ATP5F1P6-201ENST00000402768 767 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HTR4Q13639 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HTR4Q13639 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HTR4Q13639 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HTR4Q13639 MTND4LP7-201ENST00000431728 294 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HTR4Q13639 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HTR4Q13639 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HTR4Q13639 AL513321.1-201ENST00000441175 761 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HTR4Q13639 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HTR4Q13639 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HTR4Q13639 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HTR4Q13639 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HTR4Q13639 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
HTR4Q13639 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HTR4Q13639 AC133963.2-201ENST00000513686 578 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HTR4Q13639 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HTR4Q13639 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HTR4Q13639 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HTR4Q13639 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
HTR4Q13639 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HTR4Q13639 CMC2-208ENST00000564249 890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HTR4Q13639 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HTR4Q13639 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HTR4Q13639 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HTR4Q13639 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HTR4Q13639 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HTR4Q13639 AC004160.1-210ENST00000599875 689 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HTR4Q13639 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HTR4Q13639 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HTR4Q13639 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HTR4Q13639 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HTR4Q13639 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
HTR4Q13639 AC104307.1-201ENST00000616142 196 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HTR4Q13639 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.7 ms