Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AC087190.4-201ENST00000574616 8334 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 COX6CP15-201ENST00000426313 211 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AC053481.1-201ENST00000467217 306 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 RAD21-204ENST00000518055 896 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AC079070.1-201ENST00000578740 555 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 LARP1BP1-201ENST00000506036 1359 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 RNU1-130P-201ENST00000363930 160 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AL583835.1-201ENST00000399570 407 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AC112198.3-201ENST00000505950 441 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
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