Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 AC092647.2-201ENST00000452998 253 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 RPL5P30-201ENST00000465511 891 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 AP001011.1-202ENST00000581172 667 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 AC010395.1-201ENST00000507627 697 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.45
SEMA3FQ13275 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 RPL12P3-201ENST00000440080 396 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 AC142086.4-201ENST00000568904 650 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SEMA3FQ13275 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
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