Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
TRIM28Q13263 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 GPC6-AS1-201ENST00000436329 698 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 RNU1-130P-201ENST00000363930 160 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 RN7SKP222-201ENST00000410651 315 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 COX6B1P6-201ENST00000522347 255 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 MIR7973-1-201ENST00000614683 76 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 AC005858.1-201ENST00000620193 677 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 MYCT1-201ENST00000367245 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 AL590290.1-201ENST00000405336 380 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TRIM28Q13263 AL356274.1-201ENST00000617064 410 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
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