Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 RNU6-207P-201ENST00000384137 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 RPL22P22-201ENST00000395439 379 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 RNU6-334P-201ENST00000517072 102 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 LINC02267-202ENST00000522173 799 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 AL512283.1-201ENST00000606756 1384 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 STATH-202ENST00000381060 534 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 AC010460.2-201ENST00000509054 677 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 AC063947.1-201ENST00000549036 557 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 AC078909.1-201ENST00000559509 464 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 AL021368.1-201ENST00000607490 540 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 AC092638.1-201ENST00000411966 1275 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 AL512637.2-201ENST00000431287 1256 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 AL096829.2-201ENST00000446582 742 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.3 ms