Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AC026422.1-201ENST00000623961 452 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AC097717.1-228ENST00000417006 754 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 HSFY4P-201ENST00000415994 1181 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AC008121.2-201ENST00000614647 523 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CHAF1AQ13111 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
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