Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
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GRIK3Q13003 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
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GRIK3Q13003 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
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GRIK3Q13003 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
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GRIK3Q13003 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
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GRIK3Q13003 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
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