Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
GRIN2AQ12879 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GRIN2AQ12879 RPS7P2-201ENST00000435134 607 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GRIN2AQ12879 GTF2IP9-201ENST00000502460 301 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GRIN2AQ12879 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
GRIN2AQ12879 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GRIN2AQ12879 AL121594.5-201ENST00000631724 573 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GRIN2AQ12879 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GRIN2AQ12879 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
GRIN2AQ12879 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
GRIN2AQ12879 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GRIN2AQ12879 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GRIN2AQ12879 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GRIN2AQ12879 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GRIN2AQ12879 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
GRIN2AQ12879 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GRIN2AQ12879 AC069277.2-201ENST00000454211 432 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GRIN2AQ12879 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GRIN2AQ12879 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GRIN2AQ12879 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GRIN2AQ12879 AC010735.1-201ENST00000567305 1026 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GRIN2AQ12879 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
GRIN2AQ12879 AC145207.9-201ENST00000623802 325 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GRIN2AQ12879 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIN2AQ12879 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIN2AQ12879 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIN2AQ12879 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIN2AQ12879 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIN2AQ12879 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIN2AQ12879 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIN2AQ12879 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIN2AQ12879 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIN2AQ12879 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIN2AQ12879 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIN2AQ12879 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIN2AQ12879 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIN2AQ12879 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIN2AQ12879 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIN2AQ12879 MTND2P16-201ENST00000419987 799 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIN2AQ12879 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIN2AQ12879 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIN2AQ12879 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIN2AQ12879 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIN2AQ12879 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIN2AQ12879 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIN2AQ12879 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIN2AQ12879 VN1R81P-201ENST00000602085 372 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIN2AQ12879 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIN2AQ12879 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIN2AQ12879 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIN2AQ12879 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIN2AQ12879 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIN2AQ12879 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIN2AQ12879 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIN2AQ12879 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIN2AQ12879 AL035405.1-201ENST00000400795 710 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIN2AQ12879 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIN2AQ12879 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIN2AQ12879 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIN2AQ12879 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIN2AQ12879 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIN2AQ12879 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIN2AQ12879 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIN2AQ12879 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIN2AQ12879 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIN2AQ12879 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIN2AQ12879 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIN2AQ12879 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIN2AQ12879 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIN2AQ12879 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIN2AQ12879 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIN2AQ12879 AC121761.2-201ENST00000617300 689 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIN2AQ12879 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIN2AQ12879 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIN2AQ12879 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIN2AQ12879 AL049649.1-202ENST00000412405 414 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIN2AQ12879 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIN2AQ12879 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIN2AQ12879 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIN2AQ12879 AC034236.3-201ENST00000605999 461 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIN2AQ12879 AC090425.2-201ENST00000608818 501 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIN2AQ12879 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIN2AQ12879 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIN2AQ12879 OR8K5-201ENST00000313447 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
GRIN2AQ12879 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GRIN2AQ12879 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GRIN2AQ12879 CCNB2P1-201ENST00000399411 1150 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GRIN2AQ12879 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GRIN2AQ12879 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
GRIN2AQ12879 OR5H4P-201ENST00000510851 923 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GRIN2AQ12879 HMGB1P47-201ENST00000511281 589 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GRIN2AQ12879 AC006063.1-201ENST00000512511 560 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
GRIN2AQ12879 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GRIN2AQ12879 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GRIN2AQ12879 AC011124.1-204ENST00000522265 562 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
GRIN2AQ12879 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GRIN2AQ12879 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GRIN2AQ12879 AC010809.3-201ENST00000621310 641 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GRIN2AQ12879 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
GRIN2AQ12879 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.8 ms