Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
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PTPRMP28827 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
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PTPRMP28827 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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PTPRMP28827 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
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