Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 OR8K4P-201ENST00000534608 872 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 AL606834.3-201ENST00000602615 496 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 AC011458.1-201ENST00000604034 617 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 AC104763.3-201ENST00000613765 618 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 STATH-202ENST00000381060 534 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 RAB3GAP1-202ENST00000425393 1139 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 AC023632.1-201ENST00000518463 375 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 AC118942.1-201ENST00000529674 1035 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 AL022067.1-201ENST00000602426 454 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 AC069431.2-201ENST00000604149 1099 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
HOXD10P28358 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
HOXD10P28358 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
HOXD10P28358 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
HOXD10P28358 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
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HOXD10P28358 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HOXD10P28358 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HOXD10P28358 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
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HOXD10P28358 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HOXD10P28358 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HOXD10P28358 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HOXD10P28358 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
HOXD10P28358 AC074327.1-201ENST00000448017 540 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
HOXD10P28358 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HOXD10P28358 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
HOXD10P28358 MTCO3P15-201ENST00000526563 574 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HOXD10P28358 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
HOXD10P28358 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
HOXD10P28358 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
HOXD10P28358 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HOXD10P28358 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
HOXD10P28358 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HOXD10P28358 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HOXD10P28358 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
HOXD10P28358 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
HOXD10P28358 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
HOXD10P28358 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
HOXD10P28358 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
HOXD10P28358 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HOXD10P28358 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HOXD10P28358 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HOXD10P28358 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
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