Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 RPL5P30-201ENST00000465511 891 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 AC125603.1-201ENST00000552718 366 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
PTPRAP18433 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 DARS-AS1-225ENST00000615163 824 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
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