Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 MEF2C-202ENST00000424173 6336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 DNAH2-201ENST00000389173 13505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
TRIM35Q9UPQ4 ADGRE1-202ENST00000312053 3128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 HIPK2-202ENST00000406875 15049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 KLHL41-201ENST00000284669 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 AMZ2-206ENST00000577985 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 RNA5SP435-201ENST00000364044 108 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 snoU13.29-201ENST00000459370 104 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 AL589674.2-201ENST00000604304 337 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 AL352984.2-202ENST00000613699 155 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 HNF1A-AS1-205ENST00000619441 343 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 NIT2-201ENST00000394140 7289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 EFNA5-206ENST00000611503 4933 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 NPY6R-202ENST00000510937 2988 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 RABGAP1L-218ENST00000489615 6821 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 AC010168.2-201ENST00000562691 5428 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 PAQR5-201ENST00000340965 4943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 VPS13B-202ENST00000357162 14019 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC7.32□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 PPIAP20-201ENST00000449839 135 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 RN7SL284P-201ENST00000498823 275 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 Z98949.1-204ENST00000595102 731 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 AC024940.4-201ENST00000605507 246 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 ZMYND11-209ENST00000402736 3950 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 PCLO-203ENST00000423517 17147 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 LRRC7-202ENST00000310961 6507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TRIM35Q9UPQ4 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
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