Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 AP001330.2-201ENST00000523121 979 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 MIR4443-201ENST00000585052 53 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 OR7A5-202ENST00000594432 1029 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 SLC38A2-214ENST00000612232 1221 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 THRA1/BTR-204ENST00000621191 513 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 Z82217.1-201ENST00000625157 8149 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
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SH3BP4Q9P0V3 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
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SH3BP4Q9P0V3 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
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SH3BP4Q9P0V3 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SH3BP4Q9P0V3 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
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