Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TM6SF1Q9BZW5 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TM6SF1Q9BZW5 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
TM6SF1Q9BZW5 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
TM6SF1Q9BZW5 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
TM6SF1Q9BZW5 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TM6SF1Q9BZW5 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
TM6SF1Q9BZW5 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
TM6SF1Q9BZW5 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC3.89□□□□□ -1.79
TM6SF1Q9BZW5 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TM6SF1Q9BZW5 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TM6SF1Q9BZW5 AC099520.1-203ENST00000506976 464 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
TM6SF1Q9BZW5 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TM6SF1Q9BZW5 MTCO1P30-201ENST00000515244 580 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TM6SF1Q9BZW5 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TM6SF1Q9BZW5 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
TM6SF1Q9BZW5 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
TM6SF1Q9BZW5 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
TM6SF1Q9BZW5 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
TM6SF1Q9BZW5 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
TM6SF1Q9BZW5 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TM6SF1Q9BZW5 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TM6SF1Q9BZW5 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TM6SF1Q9BZW5 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TM6SF1Q9BZW5 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TM6SF1Q9BZW5 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
TM6SF1Q9BZW5 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
TM6SF1Q9BZW5 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
TM6SF1Q9BZW5 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
TM6SF1Q9BZW5 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
TM6SF1Q9BZW5 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
TM6SF1Q9BZW5 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
TM6SF1Q9BZW5 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TM6SF1Q9BZW5 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
TM6SF1Q9BZW5 CPB2-202ENST00000439329 1655 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
TM6SF1Q9BZW5 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
TM6SF1Q9BZW5 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
TM6SF1Q9BZW5 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TM6SF1Q9BZW5 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TM6SF1Q9BZW5 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TM6SF1Q9BZW5 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TM6SF1Q9BZW5 HSPD1P16-201ENST00000402302 394 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TM6SF1Q9BZW5 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
TM6SF1Q9BZW5 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TM6SF1Q9BZW5 Z93403.1-201ENST00000411879 895 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
TM6SF1Q9BZW5 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TM6SF1Q9BZW5 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
TM6SF1Q9BZW5 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
TM6SF1Q9BZW5 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TM6SF1Q9BZW5 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
TM6SF1Q9BZW5 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TM6SF1Q9BZW5 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
TM6SF1Q9BZW5 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
TM6SF1Q9BZW5 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
TM6SF1Q9BZW5 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TM6SF1Q9BZW5 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TM6SF1Q9BZW5 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
TM6SF1Q9BZW5 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
TM6SF1Q9BZW5 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TM6SF1Q9BZW5 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
TM6SF1Q9BZW5 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
TM6SF1Q9BZW5 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
TM6SF1Q9BZW5 AC027309.2-201ENST00000520566 192 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TM6SF1Q9BZW5 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
TM6SF1Q9BZW5 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC3.88□□□□□ -1.79
TM6SF1Q9BZW5 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC3.88□□□□□ -1.79
TM6SF1Q9BZW5 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
TM6SF1Q9BZW5 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC3.88□□□□□ -1.79
TM6SF1Q9BZW5 AL358333.1-201ENST00000555115 467 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
TM6SF1Q9BZW5 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
TM6SF1Q9BZW5 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TM6SF1Q9BZW5 AP001180.3-201ENST00000582221 145 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TM6SF1Q9BZW5 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TM6SF1Q9BZW5 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TM6SF1Q9BZW5 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TM6SF1Q9BZW5 AL513477.2-201ENST00000607858 568 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TM6SF1Q9BZW5 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TM6SF1Q9BZW5 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TM6SF1Q9BZW5 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TM6SF1Q9BZW5 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TM6SF1Q9BZW5 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TM6SF1Q9BZW5 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TM6SF1Q9BZW5 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TM6SF1Q9BZW5 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TM6SF1Q9BZW5 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
TM6SF1Q9BZW5 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TM6SF1Q9BZW5 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
TM6SF1Q9BZW5 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
TM6SF1Q9BZW5 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
TM6SF1Q9BZW5 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
TM6SF1Q9BZW5 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
TM6SF1Q9BZW5 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TM6SF1Q9BZW5 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TM6SF1Q9BZW5 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TM6SF1Q9BZW5 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TM6SF1Q9BZW5 TAS2R19-201ENST00000390673 1002 ntAPPRIS P1 BASIC3.87□□□□□ -1.79
TM6SF1Q9BZW5 AC025750.1-201ENST00000399891 379 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.9 ms