Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 AGGF1P8-201ENST00000562979 1000 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC1.51□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 IPMKP1-201ENST00000425988 855 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 HMGB1P47-201ENST00000511281 589 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 MTCYBP12-201ENST00000440559 1134 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 XKRY2-201ENST00000442362 1093 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 AC015771.1-201ENST00000527283 554 ntTSL 4 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 AC068599.1-201ENST00000422558 567 ntTSL 4 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 XKRYP4-201ENST00000414395 483 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 XKRYP5-201ENST00000449659 483 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 CMC2-208ENST00000564249 890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 ART3-202ENST00000349321 1528 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 AC098798.1-201ENST00000503998 1447 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 AC023128.2-201ENST00000420880 1223 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 EIF2S2P4-201ENST00000461070 984 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 FAM104B-204ENST00000472571 1109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 AC087468.1-201ENST00000604365 630 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 EXTL2P1-201ENST00000446218 416 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 AC109349.1-201ENST00000503299 758 ntTSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 OR6C65-201ENST00000379665 1076 ntAPPRIS P1 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 AC015971.1-202ENST00000439077 514 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 C1orf146-201ENST00000370373 871 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 LINC00448-202ENST00000448411 433 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 HMGN1P8-201ENST00000463578 288 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 AC023825.1-201ENST00000566704 1030 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 PSMG2-204ENST00000585331 983 ntTSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
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