Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 DPH5-204ENST00000427040 609 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 FABP7P2-201ENST00000429946 379 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 AC027308.1-201ENST00000517993 110 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 AL049839.1-201ENST00000556151 657 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 OR5AS1-201ENST00000313555 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 MIR4646-201ENST00000580775 63 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
SNX29Q8TEQ0 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.9 ms