Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Q1

SLC46A3, Solute carrier family 46 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A3Q7Z3Q1 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SLC46A3Q7Z3Q1 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SLC46A3Q7Z3Q1 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SLC46A3Q7Z3Q1 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SLC46A3Q7Z3Q1 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SLC46A3Q7Z3Q1 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SLC46A3Q7Z3Q1 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SLC46A3Q7Z3Q1 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SLC46A3Q7Z3Q1 AC093581.1-202ENST00000430890 391 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SLC46A3Q7Z3Q1 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SLC46A3Q7Z3Q1 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SLC46A3Q7Z3Q1 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SLC46A3Q7Z3Q1 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SLC46A3Q7Z3Q1 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SLC46A3Q7Z3Q1 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SLC46A3Q7Z3Q1 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SLC46A3Q7Z3Q1 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SLC46A3Q7Z3Q1 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SLC46A3Q7Z3Q1 OR9M1P-201ENST00000459641 921 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SLC46A3Q7Z3Q1 RPL38P1-201ENST00000460914 211 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SLC46A3Q7Z3Q1 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SLC46A3Q7Z3Q1 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SLC46A3Q7Z3Q1 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SLC46A3Q7Z3Q1 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SLC46A3Q7Z3Q1 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SLC46A3Q7Z3Q1 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SLC46A3Q7Z3Q1 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SLC46A3Q7Z3Q1 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SLC46A3Q7Z3Q1 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SLC46A3Q7Z3Q1 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SLC46A3Q7Z3Q1 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SLC46A3Q7Z3Q1 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SLC46A3Q7Z3Q1 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SLC46A3Q7Z3Q1 ARL6IP1P1-201ENST00000545836 610 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SLC46A3Q7Z3Q1 CCNG2P1-201ENST00000549521 1000 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SLC46A3Q7Z3Q1 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SLC46A3Q7Z3Q1 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SLC46A3Q7Z3Q1 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SLC46A3Q7Z3Q1 AC067959.1-201ENST00000604334 379 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SLC46A3Q7Z3Q1 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SLC46A3Q7Z3Q1 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SLC46A3Q7Z3Q1 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SLC46A3Q7Z3Q1 AC024941.1-201ENST00000612250 334 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SLC46A3Q7Z3Q1 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SLC46A3Q7Z3Q1 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SLC46A3Q7Z3Q1 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SLC46A3Q7Z3Q1 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SLC46A3Q7Z3Q1 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SLC46A3Q7Z3Q1 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SLC46A3Q7Z3Q1 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SLC46A3Q7Z3Q1 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SLC46A3Q7Z3Q1 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SLC46A3Q7Z3Q1 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SLC46A3Q7Z3Q1 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SLC46A3Q7Z3Q1 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SLC46A3Q7Z3Q1 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SLC46A3Q7Z3Q1 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SLC46A3Q7Z3Q1 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SLC46A3Q7Z3Q1 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SLC46A3Q7Z3Q1 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SLC46A3Q7Z3Q1 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SLC46A3Q7Z3Q1 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SLC46A3Q7Z3Q1 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SLC46A3Q7Z3Q1 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SLC46A3Q7Z3Q1 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SLC46A3Q7Z3Q1 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SLC46A3Q7Z3Q1 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SLC46A3Q7Z3Q1 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SLC46A3Q7Z3Q1 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SLC46A3Q7Z3Q1 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SLC46A3Q7Z3Q1 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SLC46A3Q7Z3Q1 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SLC46A3Q7Z3Q1 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SLC46A3Q7Z3Q1 AL139275.2-201ENST00000444731 539 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SLC46A3Q7Z3Q1 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SLC46A3Q7Z3Q1 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SLC46A3Q7Z3Q1 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SLC46A3Q7Z3Q1 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SLC46A3Q7Z3Q1 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SLC46A3Q7Z3Q1 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SLC46A3Q7Z3Q1 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SLC46A3Q7Z3Q1 AC108062.1-201ENST00000505133 637 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SLC46A3Q7Z3Q1 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SLC46A3Q7Z3Q1 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SLC46A3Q7Z3Q1 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SLC46A3Q7Z3Q1 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SLC46A3Q7Z3Q1 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SLC46A3Q7Z3Q1 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SLC46A3Q7Z3Q1 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SLC46A3Q7Z3Q1 MIR100HG-221ENST00000534297 572 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SLC46A3Q7Z3Q1 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SLC46A3Q7Z3Q1 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SLC46A3Q7Z3Q1 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SLC46A3Q7Z3Q1 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SLC46A3Q7Z3Q1 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SLC46A3Q7Z3Q1 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SLC46A3Q7Z3Q1 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SLC46A3Q7Z3Q1 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SLC46A3Q7Z3Q1 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SLC46A3Q7Z3Q1 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.3 ms