Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
LAMA3Q16787 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
LAMA3Q16787 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
LAMA3Q16787 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
LAMA3Q16787 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
LAMA3Q16787 ZNF542P-204ENST00000482727 1305 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
LAMA3Q16787 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
LAMA3Q16787 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
LAMA3Q16787 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
LAMA3Q16787 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
LAMA3Q16787 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
LAMA3Q16787 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
LAMA3Q16787 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
LAMA3Q16787 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
LAMA3Q16787 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
LAMA3Q16787 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
LAMA3Q16787 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
LAMA3Q16787 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
LAMA3Q16787 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
LAMA3Q16787 AC100782.1-201ENST00000520778 590 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
LAMA3Q16787 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
LAMA3Q16787 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
LAMA3Q16787 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
LAMA3Q16787 OR5T1-202ENST00000641665 1471 ntAPPRIS P1 BASIC1.67□□□□□ -2.14
LAMA3Q16787 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
LAMA3Q16787 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
LAMA3Q16787 FABP5P6-201ENST00000510588 409 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
LAMA3Q16787 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
LAMA3Q16787 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
LAMA3Q16787 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
LAMA3Q16787 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
LAMA3Q16787 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
LAMA3Q16787 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
LAMA3Q16787 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
LAMA3Q16787 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
LAMA3Q16787 AC093084.1-201ENST00000424233 687 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
LAMA3Q16787 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
LAMA3Q16787 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
LAMA3Q16787 VPS29-210ENST00000552130 1057 ntTSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
LAMA3Q16787 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
LAMA3Q16787 TMEM161BP1-201ENST00000457388 1457 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
LAMA3Q16787 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
LAMA3Q16787 AC098798.1-201ENST00000503998 1447 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
LAMA3Q16787 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC1.66□□□□□ -2.14
LAMA3Q16787 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
LAMA3Q16787 MTCYBP12-201ENST00000440559 1134 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
LAMA3Q16787 FAM104B-204ENST00000472571 1109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
LAMA3Q16787 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
LAMA3Q16787 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
LAMA3Q16787 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
LAMA3Q16787 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
LAMA3Q16787 ATP6V1G3-201ENST00000281087 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
LAMA3Q16787 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
LAMA3Q16787 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
LAMA3Q16787 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
LAMA3Q16787 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.14
LAMA3Q16787 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.14
LAMA3Q16787 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.14
LAMA3Q16787 MTCO3P31-201ENST00000405526 789 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
LAMA3Q16787 AC109349.1-201ENST00000503299 758 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.14
LAMA3Q16787 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.14
LAMA3Q16787 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.14
LAMA3Q16787 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
LAMA3Q16787 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
LAMA3Q16787 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
LAMA3Q16787 AC008885.2-201ENST00000509506 930 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
LAMA3Q16787 USP9YP5-201ENST00000511770 630 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
LAMA3Q16787 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
LAMA3Q16787 AL592494.3-201ENST00000609485 464 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
LAMA3Q16787 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
LAMA3Q16787 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
LAMA3Q16787 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
LAMA3Q16787 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
LAMA3Q16787 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
LAMA3Q16787 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
LAMA3Q16787 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
LAMA3Q16787 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
LAMA3Q16787 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
LAMA3Q16787 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
LAMA3Q16787 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
LAMA3Q16787 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
LAMA3Q16787 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
LAMA3Q16787 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
LAMA3Q16787 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC1.64□□□□□ -2.15
LAMA3Q16787 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
LAMA3Q16787 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
LAMA3Q16787 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
LAMA3Q16787 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
LAMA3Q16787 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
LAMA3Q16787 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
LAMA3Q16787 AL353093.1-201ENST00000441292 436 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
LAMA3Q16787 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
LAMA3Q16787 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
LAMA3Q16787 AC023825.1-201ENST00000566704 1030 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
LAMA3Q16787 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
LAMA3Q16787 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
LAMA3Q16787 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
LAMA3Q16787 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
LAMA3Q16787 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
LAMA3Q16787 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
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