Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
CLPPQ16740 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CLPPQ16740 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CLPPQ16740 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CLPPQ16740 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CLPPQ16740 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CLPPQ16740 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CLPPQ16740 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CLPPQ16740 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CLPPQ16740 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CLPPQ16740 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CLPPQ16740 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CLPPQ16740 ATP5C1P1-201ENST00000441945 895 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CLPPQ16740 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CLPPQ16740 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CLPPQ16740 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CLPPQ16740 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CLPPQ16740 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CLPPQ16740 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CLPPQ16740 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CLPPQ16740 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CLPPQ16740 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CLPPQ16740 AC116353.3-201ENST00000511215 249 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CLPPQ16740 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CLPPQ16740 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CLPPQ16740 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CLPPQ16740 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CLPPQ16740 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CLPPQ16740 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CLPPQ16740 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CLPPQ16740 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CLPPQ16740 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CLPPQ16740 VN1R78P-201ENST00000597393 564 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CLPPQ16740 AC009974.1-201ENST00000608881 455 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CLPPQ16740 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CLPPQ16740 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CLPPQ16740 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CLPPQ16740 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CLPPQ16740 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CLPPQ16740 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CLPPQ16740 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CLPPQ16740 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
CLPPQ16740 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
CLPPQ16740 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CLPPQ16740 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CLPPQ16740 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CLPPQ16740 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CLPPQ16740 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CLPPQ16740 RNU6-1242P-201ENST00000391052 103 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CLPPQ16740 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CLPPQ16740 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CLPPQ16740 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CLPPQ16740 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CLPPQ16740 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CLPPQ16740 AC016644.1-201ENST00000438553 434 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CLPPQ16740 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CLPPQ16740 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CLPPQ16740 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CLPPQ16740 AC097262.1-201ENST00000452559 548 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CLPPQ16740 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CLPPQ16740 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CLPPQ16740 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CLPPQ16740 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CLPPQ16740 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CLPPQ16740 AC015771.1-201ENST00000527283 554 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CLPPQ16740 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CLPPQ16740 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CLPPQ16740 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CLPPQ16740 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CLPPQ16740 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CLPPQ16740 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CLPPQ16740 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CLPPQ16740 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
CLPPQ16740 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CLPPQ16740 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CLPPQ16740 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CLPPQ16740 THRA1/BTR-203ENST00000604191 571 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CLPPQ16740 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CLPPQ16740 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CLPPQ16740 AC009464.1-201ENST00000615731 469 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CLPPQ16740 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CLPPQ16740 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CLPPQ16740 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
CLPPQ16740 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CLPPQ16740 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CLPPQ16740 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CLPPQ16740 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CLPPQ16740 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CLPPQ16740 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CLPPQ16740 AL592310.1-201ENST00000414330 671 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CLPPQ16740 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CLPPQ16740 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CLPPQ16740 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CLPPQ16740 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CLPPQ16740 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CLPPQ16740 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CLPPQ16740 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CLPPQ16740 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CLPPQ16740 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CLPPQ16740 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
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