Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 IGKV5-2-201ENST00000390244 408 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 RN7SL610P-201ENST00000463845 291 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 RN7SL826P-201ENST00000479724 288 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 HMGB3P22-202ENST00000451823 572 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 AP001011.1-202ENST00000581172 667 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 MIR6730-201ENST00000622213 67 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 XAGE1A-202ENST00000375600 474 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 XAGE1B-202ENST00000375613 474 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
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