Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 TRPM7-201ENST00000313478 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 PTPN3-202ENST00000374541 6703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 AC078883.1-203ENST00000416080 654 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 TIMM8BP2-201ENST00000445940 251 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 AP006222.1-205ENST00000450734 457 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 YRDCP3-201ENST00000456507 480 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 AC104339.1-201ENST00000465478 348 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 AC010325.1-202ENST00000562076 279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 MIR4502-201ENST00000580432 81 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 AL359091.2-201ENST00000609303 556 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 AC022400.9-201ENST00000623633 273 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 SLC1A2-202ENST00000395750 11538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 CDKL5-205ENST00000623535 12533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 GPATCH2L-201ENST00000261530 14007 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 DPCR1-202ENST00000462446 5314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 RNA5SP232-201ENST00000364144 119 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 AC117402.1-202ENST00000383686 820 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 LINC02522-201ENST00000431401 256 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 AC005077.1-201ENST00000449226 375 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 AC006539.1-201ENST00000481419 501 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 AC018793.4-201ENST00000524542 585 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
E2F4Q16254 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 HIPK1-204ENST00000369555 3966 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 RNU4-34P-201ENST00000410431 124 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
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