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| E2F4 | Q16254 | RIC3-202 | ENST00000335425 | 5223 nt | TSL 1 (best) BASIC | 6.61 | □□□□□ -1.35 | | |
| E2F4 | Q16254 | CLMN-201 | ENST00000298912 | 12747 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 6.61 | □□□□□ -1.35 | | |
| E2F4 | Q16254 | TEX41-207 | ENST00000445791 | 4635 nt | TSL 1 (best) BASIC | 6.61 | □□□□□ -1.35 | | |
| E2F4 | Q16254 | TRPM7-201 | ENST00000313478 | 10400 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 6.61 | □□□□□ -1.35 | | |
| E2F4 | Q16254 | PTPN3-202 | ENST00000374541 | 6703 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 6.61 | □□□□□ -1.35 | | |
| E2F4 | Q16254 | AC026951.1-201 | ENST00000559530 | 2459 nt | BASIC | 6.6 | □□□□□ -1.35 | | |
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| E2F4 | Q16254 | AL359091.2-201 | ENST00000609303 | 556 nt | BASIC | 6.6 | □□□□□ -1.35 | | |
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| E2F4 | Q16254 | AC022400.9-201 | ENST00000623633 | 273 nt | BASIC | 6.6 | □□□□□ -1.35 | | |
| E2F4 | Q16254 | PTBP3-202 | ENST00000334318 | 7990 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 6.6 | □□□□□ -1.35 | | |
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| E2F4 | Q16254 | CDKL5-205 | ENST00000623535 | 12533 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 6.6 | □□□□□ -1.35 | | |
| E2F4 | Q16254 | GPATCH2L-201 | ENST00000261530 | 14007 nt | TSL 2 BASIC | 6.6 | □□□□□ -1.35 | | |
| E2F4 | Q16254 | DSC2-202 | ENST00000280904 | 12325 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 6.59 | □□□□□ -1.35 | | |
| E2F4 | Q16254 | RNMT-201 | ENST00000262173 | 6051 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 6.59 | □□□□□ -1.35 | | |
| E2F4 | Q16254 | TLR2-201 | ENST00000260010 | 4200 nt | APPRIS P1 BASIC | 6.59 | □□□□□ -1.35 | | |
| E2F4 | Q16254 | DCC-202 | ENST00000412726 | 9525 nt | TSL 1 (best) BASIC | 6.59 | □□□□□ -1.35 | | |
| E2F4 | Q16254 | AL078621.3-201 | ENST00000623707 | 2042 nt | BASIC | 6.59 | □□□□□ -1.35 | | |
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| E2F4 | Q16254 | DPCR1-202 | ENST00000462446 | 5314 nt | APPRIS P2 TSL 5 BASIC | 6.59 | □□□□□ -1.35 | | |
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| E2F4 | Q16254 | LINC02233-201 | ENST00000513718 | 358 nt | TSL 3 BASIC | 6.59 | □□□□□ -1.35 | | |
| E2F4 | Q16254 | AC018793.4-201 | ENST00000524542 | 585 nt | APPRIS P1 BASIC | 6.59 | □□□□□ -1.35 | | |
| E2F4 | Q16254 | AP002770.2-201 | ENST00000543613 | 532 nt | BASIC | 6.59 | □□□□□ -1.35 | | |
| E2F4 | Q16254 | AC104581.2-201 | ENST00000572227 | 430 nt | BASIC | 6.59 | □□□□□ -1.35 | | |
| E2F4 | Q16254 | AL136131.3-201 | ENST00000607600 | 188 nt | BASIC | 6.59 | □□□□□ -1.35 | | |
| E2F4 | Q16254 | LINC00310-206 | ENST00000609947 | 892 nt | TSL 5 BASIC | 6.59 | □□□□□ -1.35 | | |
| E2F4 | Q16254 | ADAM20-201 | ENST00000256389 | 2795 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 6.59 | □□□□□ -1.35 | | |
| E2F4 | Q16254 | OR52A5-201 | ENST00000307388 | 3973 nt | APPRIS P1 BASIC | 6.59 | □□□□□ -1.35 | | |
| E2F4 | Q16254 | OR52A5-202 | ENST00000642125 | 3993 nt | APPRIS P1 BASIC | 6.59 | □□□□□ -1.35 | | |
| E2F4 | Q16254 | RNF128-202 | ENST00000324342 | 2654 nt | TSL 1 (best) BASIC | 6.59 | □□□□□ -1.35 | | |
| E2F4 | Q16254 | NECAB1-202 | ENST00000521366 | 2908 nt | TSL 1 (best) BASIC | 6.59 | □□□□□ -1.36 | | |
| E2F4 | Q16254 | HIPK1-204 | ENST00000369555 | 3966 nt | TSL 5 BASIC | 6.59 | □□□□□ -1.36 | | |
| E2F4 | Q16254 | NBPF19-201 | ENST00000369227 | 3670 nt | TSL 5 BASIC | 6.58 | □□□□□ -1.36 | | |
| E2F4 | Q16254 | NBPF20-203 | ENST00000594479 | 3670 nt | TSL 5 BASIC | 6.58 | □□□□□ -1.36 | | |
| E2F4 | Q16254 | NBPF14-210 | ENST00000621066 | 3670 nt | TSL 5 BASIC | 6.58 | □□□□□ -1.36 | | |
| E2F4 | Q16254 | CTXN2-201 | ENST00000417307 | 2828 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 6.58 | □□□□□ -1.36 | | |
| E2F4 | Q16254 | CNGA1-203 | ENST00000420489 | 2746 nt | APPRIS P3 TSL 2 BASIC | 6.58 | □□□□□ -1.36 | | |
| E2F4 | Q16254 | SMG1P6-201 | ENST00000532337 | 2930 nt | BASIC | 6.58 | □□□□□ -1.36 | | |
| E2F4 | Q16254 | KDM4C-214 | ENST00000536108 | 3406 nt | TSL 1 (best) BASIC | 6.58 | □□□□□ -1.36 | | |
| E2F4 | Q16254 | C1orf54-201 | ENST00000369098 | 418 nt | TSL 1 (best) BASIC | 6.58 | □□□□□ -1.36 | | |
| E2F4 | Q16254 | Y_RNA.405-201 | ENST00000383979 | 100 nt | BASIC | 6.58 | □□□□□ -1.36 | | |
| E2F4 | Q16254 | RNU6-1074P-201 | ENST00000383995 | 104 nt | BASIC | 6.58 | □□□□□ -1.36 | | |
| E2F4 | Q16254 | Y_RNA.451-201 | ENST00000384200 | 100 nt | BASIC | 6.58 | □□□□□ -1.36 | | |
| E2F4 | Q16254 | Y_RNA.524-201 | ENST00000384564 | 100 nt | BASIC | 6.58 | □□□□□ -1.36 | | |
| E2F4 | Q16254 | Y_RNA.541-201 | ENST00000384640 | 113 nt | BASIC | 6.58 | □□□□□ -1.36 | | |
| E2F4 | Q16254 | Y_RNA.561-201 | ENST00000384694 | 100 nt | BASIC | 6.58 | □□□□□ -1.36 | | |
| E2F4 | Q16254 | RNU4-34P-201 | ENST00000410431 | 124 nt | BASIC | 6.58 | □□□□□ -1.36 | | |
| E2F4 | Q16254 | AL691426.1-201 | ENST00000416507 | 509 nt | TSL 2 BASIC | 6.58 | □□□□□ -1.36 | | |
| E2F4 | Q16254 | AL117339.3-201 | ENST00000418733 | 162 nt | BASIC | 6.58 | □□□□□ -1.36 | | |
| E2F4 | Q16254 | LINC01757-201 | ENST00000435552 | 480 nt | TSL 2 BASIC | 6.58 | □□□□□ -1.36 | | |
| E2F4 | Q16254 | CXorf51B-201 | ENST00000438525 | 436 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 6.58 | □□□□□ -1.36 | | |