Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AL590103.1-201ENST00000434488 307 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 ETV5-AS1-201ENST00000453370 560 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AC007495.1-203ENST00000569025 888 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 MIR4666A-201ENST00000580160 79 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AC079089.3-201ENST00000603094 673 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 YWHAQP7-201ENST00000603536 658 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 GTF2H1-204ENST00000524753 1510 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 SAMSN1-AS1-201ENST00000449214 840 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AC099520.1-203ENST00000506976 464 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 MTCO1P30-201ENST00000515244 580 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
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