Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 AL445493.3-201ENST00000619568 477 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
USF2Q15853 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
USF2Q15853 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
USF2Q15853 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
USF2Q15853 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
USF2Q15853 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
USF2Q15853 RNU4-27P-201ENST00000410889 139 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
USF2Q15853 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
USF2Q15853 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
USF2Q15853 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
USF2Q15853 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
USF2Q15853 LINC01611-203ENST00000454981 504 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
USF2Q15853 RNU6-775P-201ENST00000459318 96 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
USF2Q15853 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AC114322.1-201ENST00000506771 926 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
USF2Q15853 SNORA76.2-201ENST00000517095 137 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
USF2Q15853 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
USF2Q15853 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
USF2Q15853 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
USF2Q15853 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AC133065.1-201ENST00000572017 575 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
USF2Q15853 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
USF2Q15853 OR4H6P-202ENST00000603819 340 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
USF2Q15853 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
USF2Q15853 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
USF2Q15853 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
USF2Q15853 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
USF2Q15853 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
USF2Q15853 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
USF2Q15853 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
USF2Q15853 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
USF2Q15853 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
USF2Q15853 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
USF2Q15853 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
USF2Q15853 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
USF2Q15853 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
USF2Q15853 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
USF2Q15853 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
USF2Q15853 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
USF2Q15853 CEP70-205ENST00000464035 1054 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
USF2Q15853 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
USF2Q15853 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
USF2Q15853 RNU6-751P-201ENST00000516382 101 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
USF2Q15853 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AC011131.1-201ENST00000521224 252 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
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USF2Q15853 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AC007906.1-201ENST00000568648 510 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AC007673.1-201ENST00000590604 1100 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AP001542.1-201ENST00000591314 200 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
USF2Q15853 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
USF2Q15853 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
USF2Q15853 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
USF2Q15853 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
USF2Q15853 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
USF2Q15853 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
USF2Q15853 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
USF2Q15853 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
USF2Q15853 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
USF2Q15853 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
USF2Q15853 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
USF2Q15853 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
USF2Q15853 SFR1P2-201ENST00000421841 730 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
USF2Q15853 OFD1P2Y-201ENST00000421895 1149 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
USF2Q15853 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
USF2Q15853 RPL7P55-201ENST00000450522 746 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
USF2Q15853 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
USF2Q15853 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
USF2Q15853 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
USF2Q15853 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AC010468.3-201ENST00000508225 458 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
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