Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SKIV2LQ15477 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SKIV2LQ15477 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SKIV2LQ15477 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SKIV2LQ15477 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SKIV2LQ15477 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SKIV2LQ15477 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SKIV2LQ15477 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SKIV2LQ15477 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SKIV2LQ15477 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SKIV2LQ15477 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SKIV2LQ15477 LEPR-205ENST00000371060 5135 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SKIV2LQ15477 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SKIV2LQ15477 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SKIV2LQ15477 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SKIV2LQ15477 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
SKIV2LQ15477 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SKIV2LQ15477 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SKIV2LQ15477 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SKIV2LQ15477 KANTR-203ENST00000604062 4251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SKIV2LQ15477 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
SKIV2LQ15477 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SKIV2LQ15477 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
SKIV2LQ15477 OR4D5-201ENST00000307033 1095 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SKIV2LQ15477 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SKIV2LQ15477 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SKIV2LQ15477 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SKIV2LQ15477 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SKIV2LQ15477 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SKIV2LQ15477 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SKIV2LQ15477 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SKIV2LQ15477 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SKIV2LQ15477 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SKIV2LQ15477 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SKIV2LQ15477 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SKIV2LQ15477 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SKIV2LQ15477 RN7SL352P-201ENST00000466002 277 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SKIV2LQ15477 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SKIV2LQ15477 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SKIV2LQ15477 AC073916.1-201ENST00000545095 130 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SKIV2LQ15477 LINC00644-201ENST00000555156 295 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SKIV2LQ15477 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SKIV2LQ15477 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SKIV2LQ15477 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SKIV2LQ15477 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SKIV2LQ15477 FAM25E-202ENST00000608562 189 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SKIV2LQ15477 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SKIV2LQ15477 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
SKIV2LQ15477 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
SKIV2LQ15477 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
SKIV2LQ15477 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 THAP6-201ENST00000311638 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 AL161621.1-201ENST00000444796 340 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 ATP2C1-203ENST00000422190 3386 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 LINC01415-201ENST00000587320 4071 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 POT1-202ENST00000393329 3950 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
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