Protein–RNA interactions for Protein: Q15465

SHH, Sonic hedgehog protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHHQ15465 AC093730.1-201ENST00000508825 448 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SHHQ15465 RNU5A-7P-201ENST00000515979 116 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SHHQ15465 SYNE2-210ENST00000553455 674 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AC006116.7-201ENST00000590141 756 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AC092070.1-201ENST00000600257 359 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AC021851.1-201ENST00000608537 1082 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AC009974.1-201ENST00000608881 455 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SHHQ15465 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AP000943.4-201ENST00000622912 357 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AC126544.2-201ENST00000625174 749 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SHHQ15465 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SHHQ15465 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SHHQ15465 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SHHQ15465 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SHHQ15465 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SHHQ15465 MFSD8-213ENST00000641134 1327 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SHHQ15465 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SHHQ15465 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SHHQ15465 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SHHQ15465 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SHHQ15465 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SHHQ15465 RNU6-609P-201ENST00000365459 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SHHQ15465 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SHHQ15465 RNU6-1242P-201ENST00000391052 103 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SHHQ15465 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SHHQ15465 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AL603865.2-201ENST00000401679 213 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SHHQ15465 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SHHQ15465 TRIM60P5Y-201ENST00000413946 574 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SHHQ15465 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SHHQ15465 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SHHQ15465 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AC092625.1-201ENST00000442706 393 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SHHQ15465 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SHHQ15465 MTND1P33-201ENST00000446251 917 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SHHQ15465 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AC091212.1-201ENST00000474798 395 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SHHQ15465 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SHHQ15465 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SHHQ15465 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SHHQ15465 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SHHQ15465 ZFAND6-208ENST00000558688 780 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SHHQ15465 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SHHQ15465 MTCO2P2-201ENST00000591258 225 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SHHQ15465 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AL357094.1-201ENST00000603845 844 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SHHQ15465 OR51F1-202ENST00000624103 939 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SHHQ15465 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SHHQ15465 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SHHQ15465 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SHHQ15465 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SHHQ15465 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SHHQ15465 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SHHQ15465 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SHHQ15465 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SHHQ15465 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SHHQ15465 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SHHQ15465 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SHHQ15465 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SHHQ15465 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SHHQ15465 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SHHQ15465 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AC118282.1-201ENST00000506408 765 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SHHQ15465 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SHHQ15465 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SHHQ15465 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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