Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 ATP5C1P1-201ENST00000441945 895 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 LINC00278-202ENST00000444263 587 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 Z99127.3-201ENST00000448158 395 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AP003485.2-201ENST00000623636 610 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AL035701.1-201ENST00000444038 462 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 UBTFL10-201ENST00000528532 562 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AC099811.4-201ENST00000592536 496 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 VN1R90P-201ENST00000595717 726 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AC008751.2-201ENST00000597885 980 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HERPUD1Q15011 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
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