Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
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COL9A3Q14050 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 AL132656.2-201ENST00000482985 1837 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
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COL9A3Q14050 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
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COL9A3Q14050 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
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COL9A3Q14050 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
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COL9A3Q14050 AL353608.2-201ENST00000425587 340 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
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COL9A3Q14050 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 AC133473.1-201ENST00000455173 299 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
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COL9A3Q14050 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
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COL9A3Q14050 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
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COL9A3Q14050 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
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COL9A3Q14050 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
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COL9A3Q14050 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 AC067968.2-201ENST00000592583 566 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
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