Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 AC010998.2-201ENST00000605549 625 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 OR5P1P-201ENST00000299512 925 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 AC008154.2-201ENST00000420268 414 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 MAPKAPK5-AS1-205ENST00000590479 543 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 AC019278.1-201ENST00000623516 479 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
SF3B2Q13435 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 AL603839.1-201ENST00000453437 432 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
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