Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 KCTD9P3-201ENST00000434597 1169 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 C1GALT1C1L-201ENST00000475092 1172 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 AC073651.3-201ENST00000545999 417 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 CHEK2P2-203ENST00000566448 670 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 SLC14A2-AS1-203ENST00000592286 528 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SNTA1Q13424 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
SNTA1Q13424 AC024560.2-201ENST00000507981 1497 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
SNTA1Q13424 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
SNTA1Q13424 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.84
SNTA1Q13424 LINC02393-202ENST00000614177 1993 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SNTA1Q13424 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SNTA1Q13424 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SNTA1Q13424 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SNTA1Q13424 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SNTA1Q13424 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SNTA1Q13424 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SNTA1Q13424 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SNTA1Q13424 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SNTA1Q13424 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SNTA1Q13424 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SNTA1Q13424 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SNTA1Q13424 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SNTA1Q13424 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SNTA1Q13424 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SNTA1Q13424 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SNTA1Q13424 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SNTA1Q13424 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SNTA1Q13424 SKP1P1-201ENST00000438081 489 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SNTA1Q13424 AL360089.1-201ENST00000442260 436 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SNTA1Q13424 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SNTA1Q13424 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SNTA1Q13424 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SNTA1Q13424 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
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