Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCGQ13326 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCGQ13326 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCGQ13326 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCGQ13326 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCGQ13326 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCGQ13326 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCGQ13326 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCGQ13326 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCGQ13326 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCGQ13326 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCGQ13326 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCGQ13326 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCGQ13326 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCGQ13326 AC111000.2-201ENST00000507775 550 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCGQ13326 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCGQ13326 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCGQ13326 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCGQ13326 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCGQ13326 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCGQ13326 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCGQ13326 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCGQ13326 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCGQ13326 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCGQ13326 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCGQ13326 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCGQ13326 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCGQ13326 AC099489.2-201ENST00000574976 260 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCGQ13326 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCGQ13326 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCGQ13326 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCGQ13326 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCGQ13326 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCGQ13326 AC244205.2-202ENST00000635781 342 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCGQ13326 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCGQ13326 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCGQ13326 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCGQ13326 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCGQ13326 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCGQ13326 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
SGCGQ13326 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
SGCGQ13326 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
SGCGQ13326 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
SGCGQ13326 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.86
SGCGQ13326 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
SGCGQ13326 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.86
SGCGQ13326 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
SGCGQ13326 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 CD2-201ENST00000369477 478 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
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SGCGQ13326 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
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SGCGQ13326 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCGQ13326 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
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