Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 DAZ2-204ENST00000382431 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 AP003170.5-201ENST00000397185 335 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 RPL23AP2-201ENST00000471227 466 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 AC008770.4-201ENST00000586394 468 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 RAPGEF4-204ENST00000409036 3975 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 FSCB-201ENST00000340446 2938 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 ATP2C1-203ENST00000422190 3386 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 RN7SL860P-201ENST00000473738 223 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 AC106894.1-201ENST00000511735 451 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 RAB9B-201ENST00000243298 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CLN3Q13286 OSBPL9-206ENST00000453295 2842 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
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