Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 AC009464.1-201ENST00000615731 469 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
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ERCC8Q13216 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
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ERCC8Q13216 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
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ERCC8Q13216 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
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ERCC8Q13216 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
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ERCC8Q13216 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
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ERCC8Q13216 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC2.35□□□□□ -2.03
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ERCC8Q13216 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 LINC00845-201ENST00000417931 696 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 CDC27P1-201ENST00000445384 715 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ERCC8Q13216 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
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