Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 AC079163.1-201ENST00000418416 407 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 AC112715.1-201ENST00000445534 350 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 AC018731.1-201ENST00000447078 576 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 AC005699.1-201ENST00000510095 555 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 AC099805.1-203ENST00000518177 773 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 AC090403.1-205ENST00000580883 516 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 ATP7A-201ENST00000341514 8483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC4.03□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 TTN-AS1-228ENST00000589234 751 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 AC097467.3-204ENST00000595229 827 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 IGKV1OR2-118-201ENST00000603238 347 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 TEX41-238ENST00000604253 709 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
GPS1Q13098 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.7 ms