Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 AC004069.2-201ENST00000505438 1114 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 PCBP2P3-201ENST00000509726 843 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 UNC13C-202ENST00000539562 938 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 AC007495.1-203ENST00000569025 888 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 DNAJC19P1-201ENST00000455312 319 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 ZC3H14-206ENST00000406216 1341 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
GRIK3Q13003 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.2 ms