Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AC027018.1-201ENST00000533978 396 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 CD2-201ENST00000369477 478 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AC074327.1-201ENST00000448017 540 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 ALDH3A2-208ENST00000571163 590 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AC018816.2-201ENST00000621460 353 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 LINC00845-201ENST00000417931 696 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 TAF8-207ENST00000482432 556 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 RN7SKP244-201ENST00000516513 307 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AC105180.1-201ENST00000523317 426 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
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