Protein–RNA interactions for Protein: Q12769

NUP160, Nuclear pore complex protein Nup160, humanhuman

Predictions only

Length 1,436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP160Q12769 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NUP160Q12769 AC090543.1-201ENST00000492168 485 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NUP160Q12769 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NUP160Q12769 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
NUP160Q12769 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NUP160Q12769 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NUP160Q12769 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NUP160Q12769 AL391834.1-201ENST00000609609 560 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NUP160Q12769 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
NUP160Q12769 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
NUP160Q12769 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
NUP160Q12769 RBMS3-AS3-202ENST00000635847 738 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
NUP160Q12769 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
NUP160Q12769 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NUP160Q12769 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NUP160Q12769 OR8H1-201ENST00000313022 1038 ntAPPRIS P2 BASIC3□□□□□ -1.93
NUP160Q12769 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NUP160Q12769 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
NUP160Q12769 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
NUP160Q12769 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NUP160Q12769 RPL31P53-201ENST00000457065 348 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NUP160Q12769 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NUP160Q12769 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NUP160Q12769 FAM60CP-201ENST00000591086 664 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NUP160Q12769 AP005212.4-201ENST00000614206 710 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NUP160Q12769 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
NUP160Q12769 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
NUP160Q12769 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NUP160Q12769 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NUP160Q12769 RNU6-1251P-201ENST00000364502 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NUP160Q12769 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
NUP160Q12769 RNU6-532P-201ENST00000384318 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NUP160Q12769 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NUP160Q12769 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NUP160Q12769 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NUP160Q12769 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NUP160Q12769 LINC01878-201ENST00000434559 769 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
NUP160Q12769 HMGB1P45-201ENST00000435986 653 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NUP160Q12769 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
NUP160Q12769 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
NUP160Q12769 MOB1AP2-201ENST00000446060 614 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NUP160Q12769 RPS15AP1-201ENST00000457423 391 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NUP160Q12769 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
NUP160Q12769 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
NUP160Q12769 MGAT4D-203ENST00000511113 1125 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
NUP160Q12769 AC010425.1-201ENST00000511734 554 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
NUP160Q12769 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NUP160Q12769 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NUP160Q12769 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NUP160Q12769 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
NUP160Q12769 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NUP160Q12769 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
NUP160Q12769 AC115989.2-201ENST00000578640 563 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NUP160Q12769 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
NUP160Q12769 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
NUP160Q12769 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NUP160Q12769 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
NUP160Q12769 AC013404.1-201ENST00000413068 249 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NUP160Q12769 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
NUP160Q12769 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NUP160Q12769 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
NUP160Q12769 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
NUP160Q12769 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
NUP160Q12769 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NUP160Q12769 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
NUP160Q12769 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
NUP160Q12769 AC068025.2-201ENST00000584958 419 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
NUP160Q12769 AC116563.2-201ENST00000624751 535 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NUP160Q12769 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NUP160Q12769 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
NUP160Q12769 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NUP160Q12769 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
NUP160Q12769 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
NUP160Q12769 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NUP160Q12769 MTCYBP29-201ENST00000436327 1006 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NUP160Q12769 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NUP160Q12769 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NUP160Q12769 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NUP160Q12769 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NUP160Q12769 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
NUP160Q12769 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
NUP160Q12769 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 LINC02301-201ENST00000553760 773 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.4 ms