Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 AL020997.3-201ENST00000602843 359 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 ELOCP35-201ENST00000604289 336 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 C11orf74-202ENST00000347206 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 ACAP2-IT1-201ENST00000419899 690 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 AL035706.1-201ENST00000439186 683 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 LINC02358-201ENST00000514413 465 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 RN7SKP157-201ENST00000516174 282 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 AP006295.1-201ENST00000532605 585 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 AL356804.1-201ENST00000553791 448 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 AP001033.2-201ENST00000609701 1003 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 MORF4L1P7-201ENST00000426038 703 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 TPTE2P1-204ENST00000435256 593 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 AC113423.1-201ENST00000523279 289 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 AL450344.2-201ENST00000455229 614 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 RNU5A-7P-201ENST00000515979 116 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 AL355802.4-201ENST00000607635 548 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 AC011330.2-201ENST00000621680 635 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CASQ1P31415 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.7 ms