Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 SNORD116-30-201ENST00000516468 85 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 Z77249.1-201ENST00000444622 1175 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 OR52A4P-203ENST00000498233 1014 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 YWHAQP7-201ENST00000603536 658 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 AP005212.4-201ENST00000614206 710 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.09
PTPRDP23468 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 AC096533.1-201ENST00000411645 353 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 AL137001.1-201ENST00000450212 199 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 MTND3P6-201ENST00000485242 339 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 AC133963.2-201ENST00000513686 578 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 AC011611.5-201ENST00000552477 578 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
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PTPRDP23468 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
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PTPRDP23468 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
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PTPRDP23468 DEFB135-201ENST00000382208 234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 AC092638.1-201ENST00000411966 1275 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
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PTPRDP23468 AC104307.1-201ENST00000616142 196 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
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PTPRDP23468 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 SERPINI2-206ENST00000471111 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
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PTPRDP23468 AL596247.1-201ENST00000416076 442 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 RPS6P14-201ENST00000425165 719 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 AC005021.1-201ENST00000608730 355 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 AL358975.1-202ENST00000628133 589 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRDP23468 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.94□□□□□ -2.1
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