Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 AC067852.7-201ENST00000623270 535 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC1.09□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 KIF14-202ENST00000614960 6838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 C1orf146-201ENST00000370373 871 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 UBE2V1P6-201ENST00000430840 422 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 GOLGA5P1-201ENST00000507317 980 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC1.09□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 STAT4-203ENST00000409995 709 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 MTCYBP19-201ENST00000517463 1124 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 AL589740.1-205ENST00000635561 565 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC1.08□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 DNAJC19P6-201ENST00000401853 280 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 AC017099.1-201ENST00000448261 1028 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 AC091544.1-201ENST00000484702 348 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 AP003049.2-202ENST00000532929 803 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 VN1R79P-201ENST00000593540 513 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.07□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC1.07□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 AC244033.1-201ENST00000426826 870 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 RPS27P5-201ENST00000444247 244 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 LNCPRESS2-201ENST00000502518 616 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 AC017076.1-201ENST00000607613 578 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 AC123767.1-201ENST00000519537 1439 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms