Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
LINC00587B1AMM8 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
LINC00587B1AMM8 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC1.67□□□□□ -2.14
LINC00587B1AMM8 AC012557.1-201ENST00000607115 611 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
LINC00587B1AMM8 AL590426.2-201ENST00000607287 786 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
LINC00587B1AMM8 AL671511.2-201ENST00000611838 659 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
LINC00587B1AMM8 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
LINC00587B1AMM8 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
LINC00587B1AMM8 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
LINC00587B1AMM8 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
LINC00587B1AMM8 OR5R1-201ENST00000623286 975 ntAPPRIS P1 BASIC1.67□□□□□ -2.14
LINC00587B1AMM8 AC026422.1-201ENST00000623961 452 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
LINC00587B1AMM8 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
LINC00587B1AMM8 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
LINC00587B1AMM8 OFD1P5Y-201ENST00000447585 2590 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
LINC00587B1AMM8 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
LINC00587B1AMM8 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
LINC00587B1AMM8 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
LINC00587B1AMM8 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
LINC00587B1AMM8 KLRC2-201ENST00000381901 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
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LINC00587B1AMM8 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
LINC00587B1AMM8 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
LINC00587B1AMM8 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
LINC00587B1AMM8 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
LINC00587B1AMM8 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
LINC00587B1AMM8 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
LINC00587B1AMM8 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
LINC00587B1AMM8 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
LINC00587B1AMM8 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
LINC00587B1AMM8 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
LINC00587B1AMM8 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
LINC00587B1AMM8 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
LINC00587B1AMM8 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
LINC00587B1AMM8 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
LINC00587B1AMM8 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
LINC00587B1AMM8 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
LINC00587B1AMM8 MIR4443-201ENST00000585052 53 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
LINC00587B1AMM8 TTN-AS1-222ENST00000587576 399 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
LINC00587B1AMM8 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
LINC00587B1AMM8 AC010615.3-201ENST00000597319 394 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
LINC00587B1AMM8 NTAN1P1-201ENST00000603150 646 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
LINC00587B1AMM8 LINC00458-206ENST00000607494 849 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
LINC00587B1AMM8 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
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LINC00587B1AMM8 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
LINC00587B1AMM8 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
LINC00587B1AMM8 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
LINC00587B1AMM8 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
LINC00587B1AMM8 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
LINC00587B1AMM8 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
LINC00587B1AMM8 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
LINC00587B1AMM8 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
LINC00587B1AMM8 AC097512.1-201ENST00000511453 1309 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
LINC00587B1AMM8 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.14
LINC00587B1AMM8 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.14
LINC00587B1AMM8 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.14
LINC00587B1AMM8 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
LINC00587B1AMM8 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
LINC00587B1AMM8 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
LINC00587B1AMM8 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
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LINC00587B1AMM8 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
LINC00587B1AMM8 AC007064.3-201ENST00000422608 359 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
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LINC00587B1AMM8 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
LINC00587B1AMM8 SPINK9-202ENST00000511717 604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
LINC00587B1AMM8 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
LINC00587B1AMM8 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
LINC00587B1AMM8 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
LINC00587B1AMM8 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
LINC00587B1AMM8 AC022511.1-201ENST00000544089 476 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
LINC00587B1AMM8 FOPNL-208ENST00000575744 565 ntTSL 4 BASIC1.65□□□□□ -2.15
LINC00587B1AMM8 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
LINC00587B1AMM8 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
LINC00587B1AMM8 AC020658.4-201ENST00000613987 684 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
LINC00587B1AMM8 AL513314.2-206ENST00000617276 434 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
LINC00587B1AMM8 AC073592.7-201ENST00000623659 507 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
LINC00587B1AMM8 OR1S1-201ENST00000624470 978 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
LINC00587B1AMM8 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
LINC00587B1AMM8 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
LINC00587B1AMM8 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
LINC00587B1AMM8 AC104446.1-201ENST00000613728 1321 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
LINC00587B1AMM8 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
LINC00587B1AMM8 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
LINC00587B1AMM8 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
LINC00587B1AMM8 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
LINC00587B1AMM8 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
LINC00587B1AMM8 LINC01953-201ENST00000426870 717 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
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