Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 FXN-205ENST00000498653 856 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 AC023043.4-201ENST00000612081 449 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 AC011266.1-201ENST00000624119 3569 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 DNAH12-202ENST00000351747 9542 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 Z97832.1-201ENST00000402490 328 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 LINC01507-201ENST00000417801 446 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 FGF7P3-201ENST00000454645 303 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 AC119150.1-201ENST00000507143 563 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 RN7SKP13-201ENST00000515933 244 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 RNA5SP73-201ENST00000516744 108 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 AC025263.2-201ENST00000550437 548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 CBX3P5-201ENST00000552017 521 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 AL352979.3-201ENST00000553515 247 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 AC022196.1-202ENST00000559570 462 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 CYP4A43P-201ENST00000568156 121 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 FBXO8-205ENST00000615392 1591 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 PRR4-201ENST00000228811 563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 AC079163.1-201ENST00000418416 407 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
UBXN4Q92575 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.5 ms