Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC2.35□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 AC068339.2-201ENST00000534395 618 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 MTCO1P18-201ENST00000455518 1419 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 CASP12-207ENST00000447913 819 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 AC093248.1-201ENST00000513197 417 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 MAL2-205ENST00000521048 575 ntTSL 4 BASIC2.34□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 AC072062.1-205ENST00000595058 962 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
IMPG1Q17R60 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 NRG4-201ENST00000394907 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 UBE2V1P11-201ENST00000411559 285 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 LINC01941-201ENST00000455174 624 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 ETFRF1-208ENST00000556402 874 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 AL512283.1-201ENST00000606756 1384 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 BCL2A1-202ENST00000335661 809 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
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