Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 OR7A5-202ENST00000594432 1029 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 ARL2BPP10-201ENST00000446487 531 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 CCL14-204ENST00000622526 472 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 CEACAMP7-201ENST00000444105 496 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 RN7SL97P-201ENST00000486780 299 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 ZNF230-204ENST00000585632 579 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 AL109935.2-201ENST00000587737 395 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 EIF3FP1-201ENST00000613970 806 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ECM1Q16610 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.6 ms